Protein–RNA interactions for Protein: P42766

RPL35, 60S ribosomal protein L35, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL35P42766 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL35P42766 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL35P42766 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL35P42766 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL35P42766 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
RPL35P42766 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL35P42766 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL35P42766 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL35P42766 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL35P42766 KCNJ12-202ENST00000583088 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
RPL35P42766 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL35P42766 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL35P42766 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL35P42766 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL35P42766 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL35P42766 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL35P42766 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
RPL35P42766 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL35P42766 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL35P42766 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL35P42766 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL35P42766 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL35P42766 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL35P42766 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
RPL35P42766 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
RPL35P42766 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL35P42766 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL35P42766 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL35P42766 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL35P42766 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL35P42766 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL35P42766 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL35P42766 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
RPL35P42766 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL35P42766 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL35P42766 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL35P42766 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL35P42766 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL35P42766 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL35P42766 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
RPL35P42766 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL35P42766 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL35P42766 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL35P42766 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL35P42766 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL35P42766 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL35P42766 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL35P42766 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL35P42766 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL35P42766 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL35P42766 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL35P42766 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
RPL35P42766 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL35P42766 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL35P42766 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL35P42766 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL35P42766 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL35P42766 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL35P42766 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL35P42766 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL35P42766 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL35P42766 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
RPL35P42766 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL35P42766 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL35P42766 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL35P42766 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL35P42766 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL35P42766 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL35P42766 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL35P42766 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
RPL35P42766 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL35P42766 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL35P42766 PAQR4-201ENST00000293978 2644 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL35P42766 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL35P42766 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
RPL35P42766 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL35P42766 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL35P42766 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL35P42766 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
RPL35P42766 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL35P42766 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL35P42766 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL35P42766 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL35P42766 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL35P42766 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL35P42766 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
RPL35P42766 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL35P42766 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL35P42766 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL35P42766 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL35P42766 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL35P42766 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL35P42766 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL35P42766 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL35P42766 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL35P42766 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
RPL35P42766 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL35P42766 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL35P42766 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
RPL35P42766 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms