Protein–RNA interactions for Protein: P41222

PTGDS, Prostaglandin-H2 D-isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDSP41222 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PTGDSP41222 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTGDSP41222 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PTGDSP41222 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.5 ms