Protein–RNA interactions for Protein: P40879

SLC26A3, Chloride anion exchanger, humanhuman

Predictions only

Length 764 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC26A3P40879 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC26A3P40879 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC26A3P40879 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC26A3P40879 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.7 ms