Protein–RNA interactions for Protein: P35443

THBS4, Thrombospondin-4, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THBS4P35443 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
THBS4P35443 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
THBS4P35443 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
THBS4P35443 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
THBS4P35443 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
THBS4P35443 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
THBS4P35443 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
THBS4P35443 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
THBS4P35443 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
THBS4P35443 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
THBS4P35443 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
THBS4P35443 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
THBS4P35443 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
THBS4P35443 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
THBS4P35443 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
THBS4P35443 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
THBS4P35443 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
THBS4P35443 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
THBS4P35443 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
THBS4P35443 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
THBS4P35443 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
THBS4P35443 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
THBS4P35443 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
THBS4P35443 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
THBS4P35443 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
THBS4P35443 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
THBS4P35443 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
THBS4P35443 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
THBS4P35443 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
THBS4P35443 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
THBS4P35443 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
THBS4P35443 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
THBS4P35443 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
THBS4P35443 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
THBS4P35443 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
THBS4P35443 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
THBS4P35443 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
THBS4P35443 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
THBS4P35443 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
THBS4P35443 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
THBS4P35443 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
THBS4P35443 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
THBS4P35443 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
THBS4P35443 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.03■□□□□ 0.96
THBS4P35443 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
THBS4P35443 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
THBS4P35443 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
THBS4P35443 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
THBS4P35443 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
THBS4P35443 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
THBS4P35443 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
THBS4P35443 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
THBS4P35443 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
THBS4P35443 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
THBS4P35443 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.01■□□□□ 0.95
THBS4P35443 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
THBS4P35443 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
THBS4P35443 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
THBS4P35443 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
THBS4P35443 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
THBS4P35443 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC21■□□□□ 0.95
THBS4P35443 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
THBS4P35443 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
THBS4P35443 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
THBS4P35443 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
THBS4P35443 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
THBS4P35443 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
THBS4P35443 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
THBS4P35443 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
THBS4P35443 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
THBS4P35443 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
THBS4P35443 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
THBS4P35443 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
THBS4P35443 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
THBS4P35443 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
THBS4P35443 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
THBS4P35443 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
THBS4P35443 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
THBS4P35443 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
THBS4P35443 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
THBS4P35443 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
THBS4P35443 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
THBS4P35443 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
THBS4P35443 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
THBS4P35443 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
THBS4P35443 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
THBS4P35443 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
THBS4P35443 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
THBS4P35443 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
THBS4P35443 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
THBS4P35443 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
THBS4P35443 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
THBS4P35443 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
THBS4P35443 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
THBS4P35443 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
THBS4P35443 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
THBS4P35443 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
THBS4P35443 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.95
THBS4P35443 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
THBS4P35443 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 125.7 ms