Protein–RNA interactions for Protein: P34995

PTGER1, Prostaglandin E2 receptor EP1 subtype, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGER1P34995 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
PTGER1P34995 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTGER1P34995 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTGER1P34995 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.3 ms