Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
DSG3P32926 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DSG3P32926 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
DSG3P32926 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
DSG3P32926 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
DSG3P32926 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
DSG3P32926 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DSG3P32926 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
DSG3P32926 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DSG3P32926 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
DSG3P32926 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
DSG3P32926 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
DSG3P32926 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DSG3P32926 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
DSG3P32926 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DSG3P32926 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
DSG3P32926 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
DSG3P32926 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
DSG3P32926 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
DSG3P32926 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
DSG3P32926 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DSG3P32926 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DSG3P32926 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DSG3P32926 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
DSG3P32926 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
DSG3P32926 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DSG3P32926 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DSG3P32926 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
DSG3P32926 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
DSG3P32926 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
DSG3P32926 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DSG3P32926 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DSG3P32926 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DSG3P32926 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DSG3P32926 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
DSG3P32926 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
DSG3P32926 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DSG3P32926 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
DSG3P32926 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
DSG3P32926 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.04
DSG3P32926 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DSG3P32926 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
DSG3P32926 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
DSG3P32926 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
DSG3P32926 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
DSG3P32926 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DSG3P32926 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DSG3P32926 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DSG3P32926 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DSG3P32926 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DSG3P32926 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
DSG3P32926 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DSG3P32926 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
DSG3P32926 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
DSG3P32926 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.79■■■□□ 2.04
DSG3P32926 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DSG3P32926 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
DSG3P32926 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DSG3P32926 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DSG3P32926 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DSG3P32926 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DSG3P32926 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DSG3P32926 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DSG3P32926 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DSG3P32926 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
DSG3P32926 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
DSG3P32926 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DSG3P32926 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
DSG3P32926 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
DSG3P32926 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.04
DSG3P32926 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DSG3P32926 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DSG3P32926 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
DSG3P32926 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
DSG3P32926 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DSG3P32926 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DSG3P32926 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DSG3P32926 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DSG3P32926 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DSG3P32926 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
DSG3P32926 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
DSG3P32926 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DSG3P32926 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
DSG3P32926 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DSG3P32926 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
DSG3P32926 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DSG3P32926 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DSG3P32926 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DSG3P32926 MYL12B-203ENST00000581193 1249 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DSG3P32926 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DSG3P32926 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DSG3P32926 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DSG3P32926 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DSG3P32926 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
DSG3P32926 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
DSG3P32926 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
DSG3P32926 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DSG3P32926 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
DSG3P32926 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
DSG3P32926 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.5 ms