Protein–RNA interactions for Protein: P32297

CHRNA3, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA3P32297 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CHRNA3P32297 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CHRNA3P32297 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHRNA3P32297 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHRNA3P32297 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.4 ms