Protein–RNA interactions for Protein: P32247

BRS3, Bombesin receptor subtype-3, humanhuman

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BRS3P32247 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRS3P32247 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRS3P32247 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
BRS3P32247 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRS3P32247 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRS3P32247 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRS3P32247 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRS3P32247 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRS3P32247 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRS3P32247 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRS3P32247 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRS3P32247 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRS3P32247 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRS3P32247 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRS3P32247 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
BRS3P32247 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRS3P32247 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRS3P32247 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRS3P32247 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRS3P32247 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRS3P32247 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
BRS3P32247 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
BRS3P32247 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
BRS3P32247 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRS3P32247 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRS3P32247 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRS3P32247 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRS3P32247 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRS3P32247 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRS3P32247 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRS3P32247 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRS3P32247 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
BRS3P32247 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRS3P32247 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRS3P32247 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRS3P32247 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRS3P32247 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRS3P32247 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRS3P32247 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRS3P32247 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRS3P32247 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRS3P32247 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
BRS3P32247 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRS3P32247 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRS3P32247 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRS3P32247 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRS3P32247 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
BRS3P32247 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRS3P32247 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
BRS3P32247 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRS3P32247 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRS3P32247 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRS3P32247 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRS3P32247 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRS3P32247 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRS3P32247 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRS3P32247 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
BRS3P32247 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRS3P32247 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRS3P32247 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRS3P32247 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRS3P32247 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
BRS3P32247 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRS3P32247 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRS3P32247 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRS3P32247 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BRS3P32247 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRS3P32247 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
BRS3P32247 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRS3P32247 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRS3P32247 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRS3P32247 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRS3P32247 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
BRS3P32247 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRS3P32247 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRS3P32247 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRS3P32247 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRS3P32247 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRS3P32247 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRS3P32247 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRS3P32247 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
BRS3P32247 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRS3P32247 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRS3P32247 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRS3P32247 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRS3P32247 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRS3P32247 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRS3P32247 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRS3P32247 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRS3P32247 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
BRS3P32247 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRS3P32247 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRS3P32247 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRS3P32247 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRS3P32247 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRS3P32247 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
BRS3P32247 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRS3P32247 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRS3P32247 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
BRS3P32247 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms