Protein–RNA interactions for Protein: P30307

CDC25C, M-phase inducer phosphatase 3, humanhuman

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC25CP30307 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
CDC25CP30307 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CDC25CP30307 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CDC25CP30307 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC25CP30307 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC25CP30307 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC25CP30307 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CDC25CP30307 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC25CP30307 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC25CP30307 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC25CP30307 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC25CP30307 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC25CP30307 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
CDC25CP30307 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC25CP30307 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC25CP30307 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CDC25CP30307 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.6 ms