Protein–RNA interactions for Protein: P30084

ECHS1, Enoyl-CoA hydratase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 290 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECHS1P30084 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
ECHS1P30084 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 SLC35B2-204ENST00000537814 1715 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
ECHS1P30084 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
ECHS1P30084 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.5 ms