Protein–RNA interactions for Protein: P29972

AQP1, Aquaporin-1, humanhuman

Predictions only

Length 269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AQP1P29972 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AQP1P29972 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AQP1P29972 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AQP1P29972 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AQP1P29972 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AQP1P29972 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AQP1P29972 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
AQP1P29972 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
AQP1P29972 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AQP1P29972 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AQP1P29972 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AQP1P29972 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AQP1P29972 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
AQP1P29972 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AQP1P29972 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
AQP1P29972 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AQP1P29972 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AQP1P29972 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AQP1P29972 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AQP1P29972 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AQP1P29972 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AQP1P29972 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
AQP1P29972 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AQP1P29972 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AQP1P29972 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AQP1P29972 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
AQP1P29972 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
AQP1P29972 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AQP1P29972 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AQP1P29972 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AQP1P29972 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AQP1P29972 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
AQP1P29972 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
AQP1P29972 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AQP1P29972 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AQP1P29972 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AQP1P29972 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
AQP1P29972 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AQP1P29972 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AQP1P29972 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AQP1P29972 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
AQP1P29972 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AQP1P29972 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AQP1P29972 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AQP1P29972 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
AQP1P29972 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
AQP1P29972 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AQP1P29972 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
AQP1P29972 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AQP1P29972 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AQP1P29972 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
AQP1P29972 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AQP1P29972 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
AQP1P29972 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
AQP1P29972 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
AQP1P29972 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AQP1P29972 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AQP1P29972 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AQP1P29972 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AQP1P29972 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AQP1P29972 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AQP1P29972 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AQP1P29972 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AQP1P29972 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AQP1P29972 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
AQP1P29972 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
AQP1P29972 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AQP1P29972 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AQP1P29972 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
AQP1P29972 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
AQP1P29972 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
AQP1P29972 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AQP1P29972 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AQP1P29972 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AQP1P29972 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
AQP1P29972 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
AQP1P29972 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AQP1P29972 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AQP1P29972 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
AQP1P29972 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AQP1P29972 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
AQP1P29972 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AQP1P29972 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AQP1P29972 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AQP1P29972 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AQP1P29972 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AQP1P29972 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
AQP1P29972 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
AQP1P29972 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AQP1P29972 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AQP1P29972 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
AQP1P29972 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
AQP1P29972 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AQP1P29972 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AQP1P29972 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AQP1P29972 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
AQP1P29972 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
AQP1P29972 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AQP1P29972 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
AQP1P29972 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms