Protein–RNA interactions for Protein: P29323

EPHB2, Ephrin type-B receptor 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,055 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB2P29323 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
EPHB2P29323 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
EPHB2P29323 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
EPHB2P29323 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
EPHB2P29323 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 142.4 ms