Protein–RNA interactions for Protein: P28715

ERCC5, DNA repair protein complementing XP-G cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC5P28715 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ERCC5P28715 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
ERCC5P28715 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 SLC6A10P-202ENST00000431994 2058 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 MLST8-219ENST00000565250 1588 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.83
ERCC5P28715 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ERCC5P28715 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.5 ms