Protein–RNA interactions for Protein: P28324

ELK4, ETS domain-containing protein Elk-4, humanhuman

Predictions only

Length 431 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELK4P28324 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ELK4P28324 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ELK4P28324 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
ELK4P28324 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ELK4P28324 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ELK4P28324 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ELK4P28324 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ELK4P28324 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
ELK4P28324 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
ELK4P28324 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
ELK4P28324 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
ELK4P28324 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
ELK4P28324 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ELK4P28324 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ELK4P28324 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ELK4P28324 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ELK4P28324 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ELK4P28324 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
ELK4P28324 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ELK4P28324 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ELK4P28324 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
ELK4P28324 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ELK4P28324 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ELK4P28324 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ELK4P28324 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ELK4P28324 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
ELK4P28324 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
ELK4P28324 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELK4P28324 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELK4P28324 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELK4P28324 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELK4P28324 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELK4P28324 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELK4P28324 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELK4P28324 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELK4P28324 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
ELK4P28324 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
ELK4P28324 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELK4P28324 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELK4P28324 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELK4P28324 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELK4P28324 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELK4P28324 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELK4P28324 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELK4P28324 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELK4P28324 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELK4P28324 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELK4P28324 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELK4P28324 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELK4P28324 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELK4P28324 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
ELK4P28324 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELK4P28324 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELK4P28324 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELK4P28324 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELK4P28324 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELK4P28324 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELK4P28324 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELK4P28324 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
ELK4P28324 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELK4P28324 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELK4P28324 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
ELK4P28324 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
ELK4P28324 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
ELK4P28324 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
ELK4P28324 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELK4P28324 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELK4P28324 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELK4P28324 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELK4P28324 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELK4P28324 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELK4P28324 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
ELK4P28324 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELK4P28324 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELK4P28324 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELK4P28324 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.44■■□□□ 1.18
ELK4P28324 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
ELK4P28324 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELK4P28324 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELK4P28324 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELK4P28324 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELK4P28324 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELK4P28324 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELK4P28324 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
ELK4P28324 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELK4P28324 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELK4P28324 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELK4P28324 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELK4P28324 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELK4P28324 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELK4P28324 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
ELK4P28324 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
ELK4P28324 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELK4P28324 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELK4P28324 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELK4P28324 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELK4P28324 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELK4P28324 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELK4P28324 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
ELK4P28324 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms