Protein–RNA interactions for Protein: P28222

HTR1B, 5-hydroxytryptamine receptor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1BP28222 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
HTR1BP28222 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
HTR1BP28222 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HTR1BP28222 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HTR1BP28222 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.5 ms