Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 CHODL-201ENST00000299295 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.91
HLA-DMAP28067 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 KRT10-201ENST00000269576 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 PHACTR2-208ENST00000440869 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 DONSON-210ENST00000453626 2332 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 SLC25A42-201ENST00000318596 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
HLA-DMAP28067 PPP2R2C-203ENST00000382599 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 KCNK13-201ENST00000282146 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 TSSK1B-201ENST00000390666 2478 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 IL17RE-201ENST00000383814 2704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 GRM6-202ENST00000517717 2673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
HLA-DMAP28067 C1QL3-201ENST00000298943 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms