Protein–RNA interactions for Protein: P28066

PSMA5, Proteasome subunit alpha type-5, humanhuman

Predictions only

Length 241 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA5P28066 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMA5P28066 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMA5P28066 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMA5P28066 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMA5P28066 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMA5P28066 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PSMA5P28066 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMA5P28066 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMA5P28066 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMA5P28066 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMA5P28066 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
PSMA5P28066 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMA5P28066 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMA5P28066 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
PSMA5P28066 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMA5P28066 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMA5P28066 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMA5P28066 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMA5P28066 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMA5P28066 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PSMA5P28066 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PSMA5P28066 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.16
PSMA5P28066 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.16
PSMA5P28066 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PSMA5P28066 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PSMA5P28066 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PSMA5P28066 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PSMA5P28066 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.13
PSMA5P28066 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PSMA5P28066 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMA5P28066 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMA5P28066 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PSMA5P28066 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.6 ms