Protein–RNA interactions for Protein: P26992

CNTFR, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTFRP26992 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
CNTFRP26992 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC19.27■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
CNTFRP26992 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
CNTFRP26992 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms