Protein–RNA interactions for Protein: P26232

CTNNA2, Catenin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 953 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNA2P26232 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTNNA2P26232 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
CTNNA2P26232 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CTNNA2P26232 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTNNA2P26232 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTNNA2P26232 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CTNNA2P26232 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA2P26232 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA2P26232 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA2P26232 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CTNNA2P26232 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNNA2P26232 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNNA2P26232 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNNA2P26232 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNNA2P26232 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
CTNNA2P26232 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA2P26232 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA2P26232 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA2P26232 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA2P26232 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA2P26232 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CTNNA2P26232 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms