Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
LAMA1P25391 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 ST3GAL6-AS1-203ENST00000488132 769 ntTSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 PFN2-210ENST00000481767 1620 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 CTAG1B-202ENST00000359887 998 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
LAMA1P25391 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 MIR663AHG-233ENST00000609248 830 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
LAMA1P25391 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms