Protein–RNA interactions for Protein: P24864

CCNE1, G1/S-specific cyclin-E1, humanhuman

Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNE1P24864 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
CCNE1P24864 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.56■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CCNE1P24864 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CCNE1P24864 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CCNE1P24864 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms