Protein–RNA interactions for Protein: P22612

PRKACG, cAMP-dependent protein kinase catalytic subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKACGP22612 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRKACGP22612 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRKACGP22612 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRKACGP22612 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKACGP22612 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKACGP22612 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKACGP22612 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKACGP22612 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKACGP22612 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKACGP22612 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKACGP22612 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKACGP22612 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRKACGP22612 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKACGP22612 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKACGP22612 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRKACGP22612 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.8 ms