Protein–RNA interactions for Protein: P22061

PCMT1, Protein-L-isoaspartate(D-aspartate) O-methyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCMT1P22061 CLPTM1-201ENST00000337392 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PCMT1P22061 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 STRBP-202ENST00000360998 2990 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
PCMT1P22061 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
PCMT1P22061 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.2 ms