Protein–RNA interactions for Protein: P21453

S1PR1, Sphingosine 1-phosphate receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
S1PR1P21453 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
S1PR1P21453 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
S1PR1P21453 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
S1PR1P21453 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.8 ms