Protein–RNA interactions for Protein: P21291

CSRP1, Cysteine and glycine-rich protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSRP1P21291 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
CSRP1P21291 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.46■■□□□ 1.35
CSRP1P21291 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRP1P21291 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRP1P21291 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRP1P21291 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRP1P21291 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
CSRP1P21291 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRP1P21291 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRP1P21291 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRP1P21291 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRP1P21291 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRP1P21291 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CSRP1P21291 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRP1P21291 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CSRP1P21291 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRP1P21291 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRP1P21291 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRP1P21291 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRP1P21291 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRP1P21291 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRP1P21291 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CSRP1P21291 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CSRP1P21291 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13 ms