Protein–RNA interactions for Protein: P21281

ATP6V1B2, V-type proton ATPase subunit B, brain isoform, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V1B2P21281 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
ATP6V1B2P21281 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 ZBTB45-205ENST00000600990 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
ATP6V1B2P21281 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 CLEC14A-201ENST00000342213 2267 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 TRIM28-202ENST00000341753 2709 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
ATP6V1B2P21281 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms