Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
CASTP20810 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASTP20810 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASTP20810 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASTP20810 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASTP20810 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
CASTP20810 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASTP20810 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASTP20810 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
CASTP20810 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CASTP20810 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CASTP20810 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC28.64■■■□□ 2.18
CASTP20810 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
CASTP20810 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASTP20810 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASTP20810 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASTP20810 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
CASTP20810 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
CASTP20810 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
CASTP20810 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASTP20810 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASTP20810 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASTP20810 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASTP20810 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
CASTP20810 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASTP20810 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASTP20810 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASTP20810 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
CASTP20810 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASTP20810 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASTP20810 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASTP20810 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASTP20810 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASTP20810 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASTP20810 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
CASTP20810 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASTP20810 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASTP20810 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASTP20810 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
CASTP20810 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
CASTP20810 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASTP20810 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASTP20810 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASTP20810 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
CASTP20810 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASTP20810 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
CASTP20810 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASTP20810 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
CASTP20810 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASTP20810 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASTP20810 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASTP20810 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASTP20810 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASTP20810 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASTP20810 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASTP20810 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASTP20810 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
CASTP20810 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASTP20810 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
CASTP20810 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASTP20810 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASTP20810 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASTP20810 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASTP20810 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASTP20810 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
CASTP20810 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASTP20810 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASTP20810 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
CASTP20810 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASTP20810 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASTP20810 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASTP20810 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
CASTP20810 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASTP20810 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASTP20810 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASTP20810 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASTP20810 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASTP20810 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
CASTP20810 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASTP20810 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASTP20810 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASTP20810 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
CASTP20810 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASTP20810 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
CASTP20810 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASTP20810 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASTP20810 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASTP20810 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASTP20810 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
CASTP20810 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CASTP20810 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
CASTP20810 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
CASTP20810 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASTP20810 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC28.46■■■□□ 2.15
CASTP20810 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASTP20810 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASTP20810 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASTP20810 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
CASTP20810 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
CASTP20810 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms