Protein–RNA interactions for Protein: P20618

PSMB1, Proteasome subunit beta type-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 241 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB1P20618 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
PSMB1P20618 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PSMB1P20618 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PSMB1P20618 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms