Protein–RNA interactions for Protein: P18669

PGAM1, Phosphoglycerate mutase 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAM1P18669 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
PGAM1P18669 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PGAM1P18669 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PGAM1P18669 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
PGAM1P18669 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms