Protein–RNA interactions for Protein: P18146

EGR1, Early growth response protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EGR1P18146 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGR1P18146 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGR1P18146 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
EGR1P18146 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGR1P18146 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
EGR1P18146 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
EGR1P18146 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EGR1P18146 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EGR1P18146 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EGR1P18146 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
EGR1P18146 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
EGR1P18146 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EGR1P18146 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
EGR1P18146 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EGR1P18146 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
EGR1P18146 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EGR1P18146 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EGR1P18146 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EGR1P18146 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
EGR1P18146 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
EGR1P18146 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR1P18146 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR1P18146 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR1P18146 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR1P18146 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR1P18146 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR1P18146 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR1P18146 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR1P18146 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
EGR1P18146 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EGR1P18146 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
EGR1P18146 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EGR1P18146 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EGR1P18146 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
EGR1P18146 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EGR1P18146 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
EGR1P18146 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EGR1P18146 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
EGR1P18146 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EGR1P18146 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
EGR1P18146 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EGR1P18146 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EGR1P18146 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EGR1P18146 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EGR1P18146 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
EGR1P18146 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EGR1P18146 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EGR1P18146 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EGR1P18146 GSK3A-201ENST00000222330 2188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
EGR1P18146 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EGR1P18146 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
EGR1P18146 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
EGR1P18146 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EGR1P18146 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EGR1P18146 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EGR1P18146 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EGR1P18146 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EGR1P18146 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
EGR1P18146 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
EGR1P18146 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
EGR1P18146 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EGR1P18146 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EGR1P18146 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EGR1P18146 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
EGR1P18146 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EGR1P18146 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
EGR1P18146 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR1P18146 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR1P18146 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR1P18146 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR1P18146 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR1P18146 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR1P18146 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
EGR1P18146 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EGR1P18146 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EGR1P18146 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EGR1P18146 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EGR1P18146 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EGR1P18146 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
EGR1P18146 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EGR1P18146 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EGR1P18146 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
EGR1P18146 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR1P18146 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR1P18146 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR1P18146 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR1P18146 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR1P18146 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR1P18146 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR1P18146 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR1P18146 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR1P18146 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR1P18146 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR1P18146 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR1P18146 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
EGR1P18146 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR1P18146 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR1P18146 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR1P18146 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
EGR1P18146 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms