Protein–RNA interactions for Protein: P17066

HSPA6, Heat shock 70 kDa protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 643 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPA6P17066 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 AC092902.2-206ENST00000625484 846 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 EGFL8-219ENST00000333845 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
HSPA6P17066 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
HSPA6P17066 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
HSPA6P17066 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HSPA6P17066 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
HSPA6P17066 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HSPA6P17066 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HSPA6P17066 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
HSPA6P17066 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HSPA6P17066 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.11■■■□□ 2.25
HSPA6P17066 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSPA6P17066 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSPA6P17066 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
HSPA6P17066 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HSPA6P17066 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
HSPA6P17066 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HSPA6P17066 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
HSPA6P17066 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HSPA6P17066 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HSPA6P17066 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
HSPA6P17066 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
HSPA6P17066 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 CDKN2A-206ENST00000494262 989 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 SLC30A5-201ENST00000380860 1317 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
HSPA6P17066 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
HSPA6P17066 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.9 ms