Protein–RNA interactions for Protein: P16104

H2AFX, Histone H2AX, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFXP16104 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 B3GALT6-201ENST00000379198 2777 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
H2AFXP16104 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 TNFSF12-TNFSF13-201ENST00000293826 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 PTH1R-207ENST00000449590 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 AC073188.6-202ENST00000616616 2281 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
H2AFXP16104 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC25.07■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 SMOX-201ENST00000278795 2164 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 ARSB-202ENST00000396151 2316 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
H2AFXP16104 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
H2AFXP16104 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.9 ms