Protein–RNA interactions for Protein: P15918

RAG1, V(D)J recombination-activating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAG1P15918 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RAG1P15918 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
RAG1P15918 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RAG1P15918 PCGF3-202ENST00000400151 1175 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAG1P15918 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAG1P15918 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
RAG1P15918 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAG1P15918 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAG1P15918 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAG1P15918 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAG1P15918 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RAG1P15918 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RAG1P15918 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RAG1P15918 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAG1P15918 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAG1P15918 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RAG1P15918 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
RAG1P15918 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RAG1P15918 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAG1P15918 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAG1P15918 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAG1P15918 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
RAG1P15918 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RAG1P15918 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAG1P15918 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAG1P15918 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAG1P15918 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAG1P15918 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
RAG1P15918 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RAG1P15918 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAG1P15918 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAG1P15918 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAG1P15918 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAG1P15918 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RAG1P15918 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAG1P15918 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAG1P15918 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAG1P15918 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAG1P15918 Z98883.1-202ENST00000635107 1289 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAG1P15918 AC093762.1-201ENST00000641981 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAG1P15918 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RAG1P15918 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAG1P15918 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAG1P15918 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAG1P15918 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RAG1P15918 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAG1P15918 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAG1P15918 AC110285.6-201ENST00000617652 491 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RAG1P15918 TAZ-216ENST00000613002 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RAG1P15918 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAG1P15918 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAG1P15918 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAG1P15918 CAPNS1-205ENST00000588780 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RAG1P15918 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAG1P15918 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAG1P15918 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
RAG1P15918 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
RAG1P15918 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAG1P15918 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAG1P15918 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAG1P15918 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAG1P15918 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAG1P15918 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
RAG1P15918 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAG1P15918 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAG1P15918 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
RAG1P15918 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RAG1P15918 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAG1P15918 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAG1P15918 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAG1P15918 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAG1P15918 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAG1P15918 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAG1P15918 CDKN2A-208ENST00000498124 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAG1P15918 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAG1P15918 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RAG1P15918 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAG1P15918 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAG1P15918 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RAG1P15918 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAG1P15918 CLEC2L-201ENST00000422142 1359 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RAG1P15918 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAG1P15918 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAG1P15918 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAG1P15918 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RAG1P15918 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAG1P15918 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
RAG1P15918 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
RAG1P15918 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAG1P15918 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAG1P15918 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAG1P15918 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAG1P15918 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAG1P15918 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAG1P15918 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAG1P15918 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
RAG1P15918 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAG1P15918 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
RAG1P15918 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
RAG1P15918 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms