Protein–RNA interactions for Protein: P14651

HOXB3, Homeobox protein Hox-B3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 431 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB3P14651 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXB3P14651 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
HOXB3P14651 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
HOXB3P14651 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
HOXB3P14651 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.5 ms