Protein–RNA interactions for Protein: P14136

GFAP, Glial fibrillary acidic protein, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFAPP14136 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GFAPP14136 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GFAPP14136 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GFAPP14136 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
GFAPP14136 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GFAPP14136 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GFAPP14136 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
GFAPP14136 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
GFAPP14136 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFAPP14136 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFAPP14136 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFAPP14136 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFAPP14136 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFAPP14136 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFAPP14136 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFAPP14136 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFAPP14136 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFAPP14136 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFAPP14136 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFAPP14136 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFAPP14136 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFAPP14136 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
GFAPP14136 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GFAPP14136 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
GFAPP14136 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
GFAPP14136 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GFAPP14136 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GFAPP14136 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GFAPP14136 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GFAPP14136 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
GFAPP14136 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GFAPP14136 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
GFAPP14136 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GFAPP14136 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GFAPP14136 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GFAPP14136 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
GFAPP14136 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GFAPP14136 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GFAPP14136 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GFAPP14136 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GFAPP14136 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GFAPP14136 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GFAPP14136 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
GFAPP14136 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
GFAPP14136 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFAPP14136 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFAPP14136 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFAPP14136 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFAPP14136 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFAPP14136 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
GFAPP14136 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFAPP14136 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
GFAPP14136 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GFAPP14136 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
GFAPP14136 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
GFAPP14136 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
GFAPP14136 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GFAPP14136 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GFAPP14136 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GFAPP14136 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
GFAPP14136 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
GFAPP14136 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GFAPP14136 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
GFAPP14136 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
GFAPP14136 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFAPP14136 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFAPP14136 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFAPP14136 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFAPP14136 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFAPP14136 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFAPP14136 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFAPP14136 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFAPP14136 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
GFAPP14136 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GFAPP14136 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GFAPP14136 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GFAPP14136 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
GFAPP14136 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GFAPP14136 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GFAPP14136 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GFAPP14136 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
GFAPP14136 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GFAPP14136 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GFAPP14136 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GFAPP14136 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GFAPP14136 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
GFAPP14136 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GFAPP14136 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GFAPP14136 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
GFAPP14136 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GFAPP14136 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GFAPP14136 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GFAPP14136 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
GFAPP14136 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
GFAPP14136 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GFAPP14136 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GFAPP14136 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
GFAPP14136 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GFAPP14136 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
GFAPP14136 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.3 ms