Protein–RNA interactions for Protein: P13727

PRG2, Bone marrow proteoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG2P13727 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRG2P13727 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRG2P13727 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRG2P13727 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRG2P13727 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRG2P13727 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRG2P13727 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PRG2P13727 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PRG2P13727 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG2P13727 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG2P13727 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PRG2P13727 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PRG2P13727 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRG2P13727 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRG2P13727 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRG2P13727 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PRG2P13727 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRG2P13727 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRG2P13727 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRG2P13727 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PRG2P13727 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRG2P13727 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRG2P13727 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRG2P13727 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PRG2P13727 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRG2P13727 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRG2P13727 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRG2P13727 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRG2P13727 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRG2P13727 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PRG2P13727 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRG2P13727 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
PRG2P13727 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRG2P13727 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRG2P13727 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRG2P13727 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PRG2P13727 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRG2P13727 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PRG2P13727 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PRG2P13727 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRG2P13727 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRG2P13727 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PRG2P13727 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PRG2P13727 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRG2P13727 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRG2P13727 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRG2P13727 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PRG2P13727 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG2P13727 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG2P13727 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG2P13727 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG2P13727 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG2P13727 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG2P13727 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG2P13727 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG2P13727 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG2P13727 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PRG2P13727 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG2P13727 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG2P13727 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG2P13727 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG2P13727 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG2P13727 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG2P13727 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG2P13727 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG2P13727 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG2P13727 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PRG2P13727 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRG2P13727 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRG2P13727 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRG2P13727 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRG2P13727 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PRG2P13727 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG2P13727 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG2P13727 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG2P13727 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG2P13727 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG2P13727 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG2P13727 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG2P13727 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PRG2P13727 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG2P13727 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG2P13727 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG2P13727 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG2P13727 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG2P13727 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
PRG2P13727 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRG2P13727 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRG2P13727 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRG2P13727 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
PRG2P13727 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
PRG2P13727 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
PRG2P13727 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRG2P13727 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRG2P13727 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRG2P13727 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRG2P13727 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
PRG2P13727 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PRG2P13727 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
PRG2P13727 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms