Protein–RNA interactions for Protein: P13647

KRT5, Keratin, type II cytoskeletal 5, humanhuman

Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT5P13647 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT5P13647 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT5P13647 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT5P13647 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
KRT5P13647 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT5P13647 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT5P13647 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT5P13647 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT5P13647 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT5P13647 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
KRT5P13647 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT5P13647 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT5P13647 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT5P13647 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
KRT5P13647 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT5P13647 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT5P13647 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT5P13647 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT5P13647 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
KRT5P13647 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT5P13647 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT5P13647 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT5P13647 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT5P13647 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT5P13647 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT5P13647 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
KRT5P13647 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT5P13647 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT5P13647 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
KRT5P13647 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT5P13647 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT5P13647 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT5P13647 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT5P13647 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT5P13647 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT5P13647 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT5P13647 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KRT5P13647 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT5P13647 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT5P13647 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT5P13647 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT5P13647 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT5P13647 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT5P13647 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KRT5P13647 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT5P13647 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT5P13647 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT5P13647 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT5P13647 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KRT5P13647 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT5P13647 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT5P13647 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT5P13647 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT5P13647 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT5P13647 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KRT5P13647 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KRT5P13647 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT5P13647 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT5P13647 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KRT5P13647 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT5P13647 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT5P13647 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT5P13647 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT5P13647 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT5P13647 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT5P13647 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT5P13647 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT5P13647 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KRT5P13647 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT5P13647 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT5P13647 CHST13-201ENST00000319340 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT5P13647 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT5P13647 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT5P13647 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
KRT5P13647 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT5P13647 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT5P13647 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT5P13647 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT5P13647 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT5P13647 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT5P13647 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT5P13647 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT5P13647 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT5P13647 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
KRT5P13647 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT5P13647 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT5P13647 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT5P13647 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
KRT5P13647 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT5P13647 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT5P13647 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT5P13647 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
KRT5P13647 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT5P13647 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
KRT5P13647 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT5P13647 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
KRT5P13647 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT5P13647 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT5P13647 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
KRT5P13647 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.4 ms