Protein–RNA interactions for Protein: P12830

CDH1, Cadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDH1P12830 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH1P12830 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH1P12830 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH1P12830 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH1P12830 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CDH1P12830 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH1P12830 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH1P12830 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH1P12830 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH1P12830 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH1P12830 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CDH1P12830 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH1P12830 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH1P12830 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH1P12830 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH1P12830 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH1P12830 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH1P12830 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH1P12830 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CDH1P12830 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH1P12830 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH1P12830 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH1P12830 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH1P12830 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CDH1P12830 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH1P12830 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH1P12830 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CDH1P12830 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH1P12830 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH1P12830 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH1P12830 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CDH1P12830 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH1P12830 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH1P12830 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH1P12830 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH1P12830 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH1P12830 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH1P12830 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CDH1P12830 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH1P12830 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH1P12830 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH1P12830 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH1P12830 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CDH1P12830 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH1P12830 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH1P12830 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH1P12830 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH1P12830 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH1P12830 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CDH1P12830 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH1P12830 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH1P12830 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH1P12830 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH1P12830 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CDH1P12830 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH1P12830 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH1P12830 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH1P12830 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH1P12830 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH1P12830 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH1P12830 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH1P12830 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH1P12830 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH1P12830 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH1P12830 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH1P12830 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH1P12830 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CDH1P12830 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH1P12830 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH1P12830 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH1P12830 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH1P12830 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH1P12830 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH1P12830 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CDH1P12830 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CDH1P12830 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH1P12830 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH1P12830 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH1P12830 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH1P12830 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH1P12830 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH1P12830 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH1P12830 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CDH1P12830 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH1P12830 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH1P12830 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH1P12830 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH1P12830 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH1P12830 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH1P12830 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CDH1P12830 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH1P12830 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH1P12830 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH1P12830 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CDH1P12830 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH1P12830 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH1P12830 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH1P12830 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH1P12830 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CDH1P12830 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms