Protein–RNA interactions for Protein: P12694

BCKDHA, 2-oxoisovalerate dehydrogenase subunit alpha, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCKDHAP12694 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCKDHAP12694 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
BCKDHAP12694 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCKDHAP12694 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
BCKDHAP12694 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
BCKDHAP12694 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
BCKDHAP12694 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms