Protein–RNA interactions for Protein: P11047

LAMC1, Laminin subunit gamma-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,609 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC1P11047 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC34.54■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
LAMC1P11047 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC34.51■■■■□ 3.11
LAMC1P11047 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC34.51■■■■□ 3.11
LAMC1P11047 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LAMC1P11047 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
LAMC1P11047 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LAMC1P11047 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC34.5■■■■□ 3.11
LAMC1P11047 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
LAMC1P11047 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.49■■■■□ 3.11
LAMC1P11047 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LAMC1P11047 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
LAMC1P11047 RBFA-201ENST00000262197 1219 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
LAMC1P11047 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
LAMC1P11047 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC34.48■■■■□ 3.11
LAMC1P11047 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.48■■■■□ 3.11
LAMC1P11047 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
LAMC1P11047 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LAMC1P11047 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
LAMC1P11047 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LAMC1P11047 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.47■■■■□ 3.11
LAMC1P11047 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
LAMC1P11047 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LAMC1P11047 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.46■■■■□ 3.11
LAMC1P11047 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC34.44■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC34.43■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.43■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.41■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.4■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
LAMC1P11047 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC34.38■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC34.38■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 MIR935-201ENST00000401179 91 ntBASIC34.37■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC34.36■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
LAMC1P11047 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 182.4 ms