Protein–RNA interactions for Protein: P10966

CD8B, T-cell surface glycoprotein CD8 beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD8BP10966 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD8BP10966 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD8BP10966 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD8BP10966 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CD8BP10966 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD8BP10966 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD8BP10966 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD8BP10966 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD8BP10966 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD8BP10966 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD8BP10966 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CD8BP10966 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD8BP10966 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD8BP10966 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD8BP10966 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CD8BP10966 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD8BP10966 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CD8BP10966 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD8BP10966 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD8BP10966 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD8BP10966 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD8BP10966 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CD8BP10966 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8BP10966 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8BP10966 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8BP10966 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8BP10966 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8BP10966 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8BP10966 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8BP10966 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8BP10966 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8BP10966 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
CD8BP10966 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CD8BP10966 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CD8BP10966 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
CD8BP10966 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD8BP10966 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD8BP10966 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CD8BP10966 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD8BP10966 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD8BP10966 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CD8BP10966 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CD8BP10966 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD8BP10966 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD8BP10966 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD8BP10966 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD8BP10966 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD8BP10966 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD8BP10966 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
CD8BP10966 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD8BP10966 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CD8BP10966 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD8BP10966 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD8BP10966 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD8BP10966 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD8BP10966 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD8BP10966 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD8BP10966 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD8BP10966 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
CD8BP10966 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD8BP10966 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD8BP10966 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD8BP10966 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD8BP10966 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
CD8BP10966 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD8BP10966 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD8BP10966 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD8BP10966 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CD8BP10966 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
CD8BP10966 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD8BP10966 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD8BP10966 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
CD8BP10966 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD8BP10966 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD8BP10966 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD8BP10966 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD8BP10966 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD8BP10966 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD8BP10966 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
CD8BP10966 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD8BP10966 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
CD8BP10966 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD8BP10966 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD8BP10966 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
CD8BP10966 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD8BP10966 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD8BP10966 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
CD8BP10966 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD8BP10966 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD8BP10966 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CD8BP10966 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CD8BP10966 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CD8BP10966 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CD8BP10966 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD8BP10966 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD8BP10966 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD8BP10966 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD8BP10966 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CD8BP10966 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CD8BP10966 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms