Protein–RNA interactions for Protein: P10911

MCF2, Proto-oncogene DBL, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCF2P10911 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
MCF2P10911 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MCF2P10911 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
MCF2P10911 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCF2P10911 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
MCF2P10911 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCF2P10911 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCF2P10911 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCF2P10911 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCF2P10911 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCF2P10911 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCF2P10911 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
MCF2P10911 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MCF2P10911 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
MCF2P10911 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCF2P10911 CDK2AP1-201ENST00000261692 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCF2P10911 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
MCF2P10911 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCF2P10911 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
MCF2P10911 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCF2P10911 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCF2P10911 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCF2P10911 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCF2P10911 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCF2P10911 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
MCF2P10911 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
MCF2P10911 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCF2P10911 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCF2P10911 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCF2P10911 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCF2P10911 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCF2P10911 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
MCF2P10911 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCF2P10911 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCF2P10911 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCF2P10911 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
MCF2P10911 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCF2P10911 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCF2P10911 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCF2P10911 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCF2P10911 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCF2P10911 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCF2P10911 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCF2P10911 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCF2P10911 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
MCF2P10911 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCF2P10911 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCF2P10911 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
MCF2P10911 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MCF2P10911 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
MCF2P10911 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCF2P10911 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCF2P10911 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCF2P10911 MTX2-204ENST00000443241 799 ntTSL 3 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCF2P10911 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCF2P10911 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCF2P10911 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCF2P10911 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
MCF2P10911 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCF2P10911 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCF2P10911 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
MCF2P10911 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCF2P10911 UBE2E3-202ENST00000410062 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
MCF2P10911 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCF2P10911 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCF2P10911 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
MCF2P10911 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
MCF2P10911 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCF2P10911 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCF2P10911 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCF2P10911 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCF2P10911 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCF2P10911 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCF2P10911 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCF2P10911 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
MCF2P10911 RHOF-203ENST00000537171 1485 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
MCF2P10911 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCF2P10911 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCF2P10911 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCF2P10911 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
MCF2P10911 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
MCF2P10911 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCF2P10911 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCF2P10911 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCF2P10911 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCF2P10911 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCF2P10911 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
MCF2P10911 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
MCF2P10911 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCF2P10911 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCF2P10911 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCF2P10911 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCF2P10911 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCF2P10911 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCF2P10911 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCF2P10911 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCF2P10911 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCF2P10911 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
MCF2P10911 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
MCF2P10911 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.9 ms