Protein–RNA interactions for Protein: P10644

PRKAR1A, cAMP-dependent protein kinase type I-alpha regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKAR1AP10644 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PRKAR1AP10644 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 AL160276.1-201ENST00000636672 1312 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 OSCAR-206ENST00000391760 629 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 AC239859.2-201ENST00000444165 318 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
PRKAR1AP10644 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 HOXC-AS1-201ENST00000505700 548 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
PRKAR1AP10644 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms