Protein–RNA interactions for Protein: P0C8F1

PATE4, Prostate and testis expressed protein 4, humanhuman

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATE4P0C8F1 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATE4P0C8F1 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATE4P0C8F1 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATE4P0C8F1 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATE4P0C8F1 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PATE4P0C8F1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATE4P0C8F1 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PATE4P0C8F1 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATE4P0C8F1 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATE4P0C8F1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATE4P0C8F1 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATE4P0C8F1 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PATE4P0C8F1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 USP2-204ENST00000525735 1704 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 PAPOLA-225ENST00000557471 1421 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PATE4P0C8F1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 UBALD2-201ENST00000327490 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 RCCD1-206ENST00000556618 1556 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
PATE4P0C8F1 TOMM40-203ENST00000426677 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
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