Protein–RNA interactions for Protein: P09110

ACAA1, 3-ketoacyl-CoA thiolase, peroxisomal, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACAA1P09110 C15orf59-201ENST00000379822 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
ACAA1P09110 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 GAL3ST2-201ENST00000192314 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 HMGA2-201ENST00000354636 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ACAA1P09110 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 ANKRD20A11P-201ENST00000344693 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 SH2B1-205ENST00000538342 1532 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 RDH14-201ENST00000381249 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ACAA1P09110 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.8 ms