Protein–RNA interactions for Protein: P09017

HOXC4, Homeobox protein Hox-C4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC4P09017 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
HOXC4P09017 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 HOXB3-202ENST00000460160 1525 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 DGAT1-201ENST00000332324 1473 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 SLC39A3-201ENST00000269740 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXC4P09017 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 AL022341.2-201ENST00000573609 1417 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 SYT7-202ENST00000535826 1621 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 RABL6-204ENST00000371671 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 IL15RA-214ENST00000525219 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXC4P09017 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 REEP6-201ENST00000233596 1794 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXC4P09017 FGD5-AS1-204ENST00000430166 1184 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms