Protein–RNA interactions for Protein: P08729

KRT7, Keratin, type II cytoskeletal 7, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT7P08729 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT7P08729 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
KRT7P08729 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT7P08729 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT7P08729 BSCL2-205ENST00000403550 1693 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT7P08729 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT7P08729 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT7P08729 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT7P08729 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT7P08729 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
KRT7P08729 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT7P08729 CASP9-201ENST00000333868 2019 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT7P08729 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT7P08729 CCDC71L-201ENST00000315965 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT7P08729 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT7P08729 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
KRT7P08729 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT7P08729 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT7P08729 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
KRT7P08729 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT7P08729 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT7P08729 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT7P08729 ATPAF1-213ENST00000574428 1760 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT7P08729 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT7P08729 PVT1-212ENST00000521951 1535 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT7P08729 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
KRT7P08729 RRP9-201ENST00000232888 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT7P08729 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT7P08729 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT7P08729 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT7P08729 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT7P08729 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT7P08729 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT7P08729 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT7P08729 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
KRT7P08729 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT7P08729 MROH6-210ENST00000533679 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT7P08729 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT7P08729 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25■■□□□ 1.59
KRT7P08729 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT7P08729 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT7P08729 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
KRT7P08729 PTPMT1-205ENST00000534775 1611 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT7P08729 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
KRT7P08729 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT7P08729 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT7P08729 ALKAL1-201ENST00000358543 1217 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT7P08729 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT7P08729 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
KRT7P08729 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT7P08729 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT7P08729 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT7P08729 AC097639.1-201ENST00000565519 1891 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
KRT7P08729 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT7P08729 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT7P08729 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT7P08729 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT7P08729 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT7P08729 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT7P08729 CHKA-202ENST00000356135 1755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
KRT7P08729 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT7P08729 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT7P08729 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT7P08729 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT7P08729 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
KRT7P08729 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT7P08729 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT7P08729 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
KRT7P08729 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT7P08729 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT7P08729 WDR38-203ENST00000618744 1270 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT7P08729 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
KRT7P08729 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT7P08729 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT7P08729 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT7P08729 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT7P08729 SLC52A2-208ENST00000527078 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT7P08729 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT7P08729 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
KRT7P08729 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT7P08729 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT7P08729 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT7P08729 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT7P08729 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT7P08729 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT7P08729 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT7P08729 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT7P08729 TMUB1-202ENST00000392818 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
KRT7P08729 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT7P08729 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT7P08729 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT7P08729 HSBP1L1-201ENST00000451882 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT7P08729 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
KRT7P08729 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT7P08729 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT7P08729 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT7P08729 MEIS3-204ENST00000558555 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT7P08729 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
KRT7P08729 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
KRT7P08729 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms