Protein–RNA interactions for Protein: P08183

ABCB1, Multidrug resistance protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCB1P08183 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 ANKRD16-202ENST00000380092 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 RCCD1-203ENST00000555155 1871 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 LRFN4-202ENST00000393952 1550 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ABCB1P08183 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 AC096887.2-201ENST00000623443 1957 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 VAX1-202ENST00000369206 1723 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 CRACR2B-201ENST00000450448 1663 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
ABCB1P08183 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 ITGB3-202ENST00000571680 1668 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 TTBK2-205ENST00000567274 1777 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
ABCB1P08183 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms