Protein–RNA interactions for Protein: P07951

TPM2, Tropomyosin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPM2P07951 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TPM2P07951 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TPM2P07951 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TPM2P07951 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.02■■□□□ 1.92
TPM2P07951 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
TPM2P07951 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TPM2P07951 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TPM2P07951 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TPM2P07951 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TPM2P07951 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TPM2P07951 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TPM2P07951 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TPM2P07951 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TPM2P07951 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TPM2P07951 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TPM2P07951 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
TPM2P07951 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TPM2P07951 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TPM2P07951 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TPM2P07951 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
TPM2P07951 POLE2-201ENST00000216367 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TPM2P07951 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
TPM2P07951 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
TPM2P07951 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPM2P07951 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPM2P07951 SNX10-207ENST00000446848 2613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPM2P07951 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPM2P07951 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPM2P07951 MCUB-201ENST00000394650 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPM2P07951 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPM2P07951 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
TPM2P07951 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPM2P07951 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPM2P07951 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
TPM2P07951 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPM2P07951 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
TPM2P07951 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
TPM2P07951 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPM2P07951 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPM2P07951 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPM2P07951 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPM2P07951 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPM2P07951 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPM2P07951 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
TPM2P07951 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TPM2P07951 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TPM2P07951 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
TPM2P07951 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TPM2P07951 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
TPM2P07951 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TPM2P07951 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
TPM2P07951 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPM2P07951 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPM2P07951 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPM2P07951 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPM2P07951 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPM2P07951 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPM2P07951 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
TPM2P07951 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPM2P07951 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPM2P07951 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPM2P07951 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPM2P07951 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPM2P07951 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
TPM2P07951 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPM2P07951 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPM2P07951 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPM2P07951 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPM2P07951 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPM2P07951 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPM2P07951 DENND1A-201ENST00000373618 3003 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPM2P07951 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPM2P07951 HORMAD2-201ENST00000336726 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
TPM2P07951 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPM2P07951 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPM2P07951 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPM2P07951 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPM2P07951 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPM2P07951 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPM2P07951 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
TPM2P07951 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
TPM2P07951 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
TPM2P07951 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
TPM2P07951 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
TPM2P07951 ASRGL1-202ENST00000415229 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPM2P07951 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPM2P07951 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPM2P07951 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPM2P07951 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPM2P07951 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
TPM2P07951 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPM2P07951 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPM2P07951 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPM2P07951 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
TPM2P07951 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TPM2P07951 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TPM2P07951 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TPM2P07951 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TPM2P07951 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
TPM2P07951 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.5 ms