Protein–RNA interactions for Protein: P07437

TUBB, Tubulin beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBBP07437 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBBP07437 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
TUBBP07437 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBBP07437 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBBP07437 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TUBBP07437 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBBP07437 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBBP07437 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBBP07437 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBBP07437 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TUBBP07437 NKX2-3-202ENST00000622383 1986 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TUBBP07437 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBBP07437 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBBP07437 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBBP07437 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBBP07437 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBBP07437 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBBP07437 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBBP07437 MAGED2-206ENST00000375068 2189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
TUBBP07437 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBBP07437 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBBP07437 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBBP07437 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBBP07437 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBBP07437 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBBP07437 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TUBBP07437 EVA1C-203ENST00000401402 1558 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBBP07437 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBBP07437 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBBP07437 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBBP07437 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBBP07437 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBBP07437 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBBP07437 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBBP07437 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TUBBP07437 HSPBP1-201ENST00000255631 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBBP07437 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
TUBBP07437 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBBP07437 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBBP07437 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBBP07437 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TUBBP07437 CLDN5-201ENST00000403084 2357 ntBASIC25■■□□□ 1.59
TUBBP07437 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBBP07437 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBBP07437 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBBP07437 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBBP07437 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBBP07437 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TUBBP07437 IFNL4-201ENST00000606380 1637 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBBP07437 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBBP07437 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBBP07437 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBBP07437 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TUBBP07437 PEBP1-201ENST00000261313 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBBP07437 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBBP07437 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBBP07437 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TUBBP07437 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBBP07437 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBBP07437 KAT5-208ENST00000530446 1697 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBBP07437 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBBP07437 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBBP07437 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TUBBP07437 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
TUBBP07437 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBBP07437 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBBP07437 CAMK2N1-201ENST00000375078 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBBP07437 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TUBBP07437 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBBP07437 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBBP07437 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBBP07437 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBBP07437 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBBP07437 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBBP07437 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBBP07437 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBBP07437 PAIP1-208ENST00000514514 1603 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
TUBBP07437 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBBP07437 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBBP07437 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBBP07437 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBBP07437 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBBP07437 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBBP07437 TMEM102-201ENST00000323206 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TUBBP07437 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBBP07437 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBBP07437 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBBP07437 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBBP07437 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBBP07437 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TUBBP07437 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBBP07437 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBBP07437 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBBP07437 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBBP07437 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBBP07437 PRSS56-201ENST00000449534 2157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBBP07437 PRSS56-203ENST00000617714 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TUBBP07437 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBBP07437 TMEM203-201ENST00000343666 1557 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TUBBP07437 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.4 ms